Las líneas de trabajo que llevo adelante incluyen la genómica microbiana de patógenos de importancia para la salud, con énfasis en la caracterización y el análisis de la resistencia a los antimicrobianos, así como el estudio del microbioma en especies productivas y del ambiente. Desde 2018 me he especializado en la aplicación de tecnologías de secuenciación de tercera generación Oxford Nanopore Technologies. Utilizo esta tecnología para estudios de metabarcoding de microorganismos procariotas y eucariotas, la obtención y ensamblaje de genomas completos de aislamientos bacterianos, y el desarrollo de herramientas bioinformáticas para el análisis de lecturas largas. Asimismo, empleo diversas estrategias de metagenómica orientadas al análisis integral del microbioma animal, lo que permite la caracterización taxonómica y funcional de comunidades microbianas complejas.
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Email: csalazar@pasteur.edu.uy ORCID:https://orcid.org/0000-0002-6017-4593 CVUy:see Institution: Instituto Pasteur de Montevideo Other Institution: Instituto de Investigación Una Salud